• Gabedit: Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess ve Q-Chem gibi hesaplamalı teorik kimya programlarının grafik kullanıcı arayüzünü sağlayan bir program olarak sourceforge’da tam sürüm olarak dağıtımı yapılan bir program. Değişik hesaplama sonuçlarını gösterebilmektedir. Bir çok yaygın moleküler dosya formatını desteklemekte olan bu program aynı zamanda sizin de molekül çizimi yapmanıza olanak sağlamakta. Bu işleri yaparken 3 boyutlu görseller üretmekte. Ve bir çok vektörel ve pixel tabanlı formata da aktarma yapabilmekte. Bu bakımdan yayın hazırlayan arkadaşların çok işine yarapayacağını düşünmekteyim.
  • BK Chem
  • ChemSketch
  • ChemDraw
  • ChemAxon
  • Accelrys Software: Çoğu bedava olan 3 boyutlu render araçları da oldukça güçlü bilimsel çalışmaları görselleştirmeye yarayan toollar içermekte. Basit çizim uygulamaları da mevcut. Ücretsiz olarak indirilip kullanılabilir.
  • NWChem : Kuantum kimyası ve katı hal ile hesaplamaları da yapabilen güzel bir program
  • Fityk: Özellikle XPS, FTIR ve Raman spektroskopisi ile elde edilen spektraları oluşturan ana bandlara katkı veren pikleri sığdırma, yerleştirme (fitting) işlemi yapmak için güzel yararlı ve ücretsiz bir program.
  • KolXPD: Fityk gibi ve fakat zaman kısıtlı (trail) versiyonunu 1 ay kadar kullanabileceğiniz, sitesindeki videosu sayesinde kolayca izleyip tekrar edebileceğiniz, geniş bir versiyon ve dosya uzantısı desteği bulunan yerleştirme, sığdırma programı. Bu programların dışında http://www.uksaf.org/software.html adresinde gayet yararlı bilink var. Yukarıdaki iki program yeterli olmakla birlikte bu konuda diğer programlara da bakmakta yarar var.
  • KingDraw: KingDraw uygulaması Android ve IOS mobil ve windows platformları için geliştirilmiş molekül çizimlerini ve kimyasal reaksiyonları kolaylıkla yapabildiğiniz bir ücretsiz kimyasal çizim programıdır. Bu programla aynı zamanda sentez adımlarını, mekanizmalarını rahatlıkla çizebilirsiniz. Kullanıcılar aynı zamanda bileşik özelliklerini analiz edebilir, kimyasal yapıları IUPAC isimlerini çevirebilir, 3 boyutlu modeli görebilirsiniz. Programla aynı zamanda çizimlerinizi Microsoft Office uygulamalarına, ChemDraw uygulamasına ve resim olarak dışa aktarım seçenekleri de mevcut. Bu yeni program konu ile ilgilenenlerin ilgisini çekecektir(25.12.2019).
  • https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov: Pubchem sayfasının web tabanlı çizim arayüzü.
  • MedChem Designer™: Bu ticari ürünleri olan şirketin ücretsiz yazılımı ile kimyasal yapılar da çizilebilirken aynı zamanda SMILES, SDF, MOL, CSK ve RXN uzantılı dosya türlerini de açabilmekte. 32 türe kadar bileşik tek bir ekranda görülebilmekte. SMILES, SD, MOL, CQF, bitmap (BMP), JPG ve PNG formatlarında dışa aktarım mümkün. Moleküllerin logP, logD, topolojik kutup yüzey alanları (TPSA) kolaylıkla hesaplanıp gösterilebilmekte. Bunlara ek olarak yapı görseli, tahmin edilen özellikleri Excel formatına aktarılabilmekte (01.01.2020).
  • BIOVIA Draw
  • Avogadro: Ücretsiz olarak gelişmiş molekül platformlar arası çalışabilen düzenleyici, görselleştirici olan bu uygulama ile hesaplamalı kimya çalışmalarınızı, moleküler modellemelerinizi, biyoinformatik, materyal bilimi ve bu alanlar ile alakalı çalışmalarınızı yapabilirsiniz. Program aynı zamanda esnek ve yüksek kalitede render yapabilmekte ve güçlü bir eklenti mimarisi içermekte (01.01.2020).

Not: Bu sayfa internette gezdikçe geliştirdiğim bir bölümdür.