İnternette gezerken…

Gabedit

Gallik asit molekülü: Buraya animasyonlu bir gif koyacaktım ve fakat gereğinden fazla vakit aldığı için bu zahmete girmek istemedim.

Gallik asit molekülü

sourceforge.netadresi altındaki bir çok proje hayatıma daha çok grafik tasarımı ve web tasarımı ile ilgili uygulamalar ve projelerle girmişti. Bu ortam sağlayıcı site bedava yazılımın netteki bir başka kalesi idi. İçinde irili ufaklı ama bedava her türlü uygylamayaı içinde barındırıyordu önceleri. Bu uygulamalar günümüzde artık çok özel alanlardaki çözümleri de içinde barındırır olmuş. Molekül görselleştirme ile ilgili uygulamalar ararken bir şekilde yolum Gabedit’ten geçti. İlginç bir şekilde seneler sonra yine sourceforge.net adresinden programı indirince anılarım ve depreşti geçmiş 10 yıla dair. Ama buna girmeyden, programdan kısa bir kaç cümle ile bahsetmek istiyorum.

Gabedit, Gamess-US, Gaussian, Molcas, Molpro, MPQC, OpenMopac, Orca, PCGamess ve Q-Chem gibi hesaplamalı teorik kimya programlarının grafik kullanıcı arayüzünü sağlayan bir program olarak sourceforge’da tam sürüm olarak dağıtımı yapılan bir program. Değişik hesaplama sonuçlarını gösterebilmektedir. Bir çok yaygın moleküler dosya formatını desteklemekte olan bu program aynı zamanda sizin de molekül çizimi yapmanıza olanak sağlamakta. Bu işleri yaparken 3 boyutlu görseller üretmekte. Ve bir çok vektörel ve pixel tabanlı formata da aktarma yapabilmekte. Bu bakımdan yayın hazırlayan arkadaşların çok işine yarapayacağını düşünmekteyim.

Teorik kimya ile uğraşan Türkçe konuşan arkdaşlara yararlı olacağını düşünerek burada bunu yazıyorum. Özellikle ben Kızılötesi titreşim modlarını görselleştirirken ve anime ederken çok yararlardım. Kuşkusuz başka bir çok yararı var. Siztesinden okuaybilirsiniz.

Dünya Üniversiteleri İlk 400 sıralaması

Dünyada ilk 400’e girmiş olan üniversitelerin 2012 yılı değerlerlendirmesi Thomson Routers‘a aie olan Times Higher Education sitesinde yayınlandı. Listede ilk 400’e giren üniversitelere göz gezdirirken Türkiyeden olanları şöyle bir listelemenin toplu halde Türkiye açısından tabloyu görmek bakımından yararlı olacağını düşünüyorum.

  1. 201-225 arasında Bilkent University Turkey
  2. 276-300 arasında Istanbul Technical University Turkey
  3. 276-300 arasında Middle East Technical University Turkey
  4. 301-350 arasında Boğaziçi University Turkey

Listeye girmiş üniversitelerimiz bu şekilde. Öbür taraftan söylenebilir ki tüm ölçümler içindeki kabule göre görecelik arzeder. Bu 4 üniversitenin dışındaki üniversiteler ismi zikredilmediğinden önemsizmiş gibi görünebilir. Bu yanlış bir değerlendirmeolur bence. Bilkent üniversitesini bu noktada çalışmaları ile çok daha öne geçmiş görüyorum. İTÜ’nün ikinci sırada gelmesi ve ardından da ODTÜ’nün gelmesi gerçekten ilginç. Çünkü ODTÜ uzun süreler Türkiye’nin en iyi üniversitesi idi. Bu listeye girenler arasında en üst sırada olmasını beklemem biraz da bu önceki bilgilerimden kaynaklanıyor. Üniversiteler de yaşayan organizmalar gibi tabi değişebiliyor.

Listedeki üniversitelerin hesaplanması yönteminden biraz bahsedersek. En azından kritelerlere biraz değinmiş olur, daha açıklayıcı bir yazı yazmış oluruz diye düşünüyorum.

Bu 4 üniversitesimizin hiç birisi özel olarak bu 4 kriterden birisi için yapılan sıralamada ilk 200 içine girmediğinden bu kriterler için teker teker kaçıncı sırada olduğunu siteden görmek mümkün olamıyor.

Üniversite tercihleri yapıldığı bu dönemde. Öğrencilerin karar verirken bunu da dikkate almalarını ümid ediyorum.

 

İki Yeni Element Daha

İki yeni element Flerovyum ve Livermoryum ile birlikte periyodik cetvelin element sayısı 118’e çıktı.

31 Mayıs 2012 tarihinde IUPAC (Uluslararası Uygulamalu ve Saf Kimya Birliği) Flerovyum ve Livermoryum elementlerinin varlığını onayladı.

Amarikadaki Lawrence Ulusal Labaratuvarı ve Rusyadaki Nükleer Araştırmalar Ortak Enstitüsünden bilimadamlarının ortaklaşa çalışmaları sonucunda bulunan bu iki elementin resmi ilanı Haziran 2012  tarihinde IUPAC  dergilerinden Pure and Applied Chemistry dergisi sayısında yapılacak.

Flerovyum (Fl) atom numarası 114 ve atom ağarlığı ise 289 olarak belirlenirken, Rusya Nükleer Araştırmalar Ortak Enstitüsü kurucusu Georgiy N. Flerov (1913 – 1990) isimli fizikçinin adını taşımakta. Ve Livermoryum (Lv) ise atom numarası 116ve atom ağarlığı ise 293 olarak belirlenirken, Amerika Lawrence Livermore Ulusal Labaratuvarınındanadını almakta. Bu iki elementin varlığının naıtlanması titizlik gerektiren bir bilimsel ispat sürecinden sonra ortaya çıkmakta. Hal böyle olunca da bu tür buluşlar için ciddi bilimsel yatırımlar ve ancak ülkelerin ulusal labaratuvarlarında sağlanabilecek bilimsel yeterlilik gerektirmekte. Bilimde isim vermek bulanın hakkı olduğundan elementlerin adları da bu şekilde ülkelere veya bilim adamı isimlerine mal olmakta.

The IUPAC reviews and confirms the reported discovery of new elements then, approves the proposed names for new elements. The confirmation and approval process usually entails a few years of repeated experimentation in independent laboratories to verify the results of the discovery of a new element. As of May 31, 2012 the IUPAC has confirmed and approved the names for 114 elements (Here’s the official IUPAC periodic table). Scientists have reported discoveries for other elements, but these results have not yet been confirmed.

IUPAC tüm dünya tarafınfan otoritesi kabul edilmiş ve alanda standartları koyan ve onayları veren bir uluslararası topluluk olarak önemini kurulduğu günden beri sürdürmekte. Bu kritik önem, bilimsel süreçlerin standardizasyonunu sağlamakta. Bu alanda ortak dili geliştirmekte. Bu dil aynı zamanda modern teknolojinin diline de uyum sağlama amacını da taşımakta.

Kaynak: earthsky.org

Google ve Kimya Arasında ne bağlantı var?

Google ve Kimya Arasında ne bağlantı var?

Su moleküllerinin hidrojen bağlı yapıları gibi karmaşık sistemleri ve bunların çözünmedeki rollerini anlamak için kimyacıların muhtemelen tek kullandıkları network modeli Google PageRank sistemi değildir. Bununla birlikte, Amerika Washington State Üniversitesinden Aurora Clark, Google/Stanford Üniversitesinin geliştirdiği web sayfaları kataloglamak ve ilişkilendiren arama motorları için geliştirilen PageRank aşağıdaki formülünü kullanarak, araştırmacılar sadece kimyacıların işini kolaylaştırmamış, aynı zamanda yoğunlaşmış fazdaki moleküllerin biribirleri ile etkileşimi anlamak için yeni bir bakış açısı ortaya koymuş oldular. Devamını Oku